Das Hotel Yellow Submarine II St. Augustine liegt in der Nähe vom Weingut San Sebastian Winery, und zwar etwa 25 Gehminuten von hier entfernt. Die Pension verfügt auch über einen privaten Autoparkplatz.
Das Hotel ist in einer 2 km Entfernung vom Piratenmuseum von St. Augustine gelegen. Das Castillo de San Marcos National Monument gehört zu den historischen Sehenswürdigkeiten und liegt in ungefähr 30 Gehminuten Entfernung von der Unterkunft. Vom Yellow Submarine II aus liegt das Schönste der Stadt zum Greifen nah und das Florida's Oldest House Museum ist 3 Kilometer von entfernt. Für Fernreisende ist der Flughafen Nordost-Florida in 10 Minuten mit dem Auto zu erreichen.